后来果然将这位知县召回重用。杨荣曾劝他“事已裁决，不必再劳神”，他却说：“一着不慎，就可能冤枉好人，懈怠不得。”
永乐十八年，朱棣决定迁都北京，命朱高炽负责南京的收尾工作。当时很多官员不愿北上，朱高炽一面安抚，说“南北一体，皆为朝廷”，一面奏请朱棣允许年老体弱的官员留任南京，这个提议被采纳后，不少官员感念其体恤。《翰林记》中记载，有位老御史临别时赠他一首诗：“监国十年恩似海，南京城畔柳如烟”，朱高炽把诗挂在书房，说“这是对我的鞭策”。
永乐二十二年（1424年），朱棣在北征途中病逝，朱高炽继位，改元洪熙。他登基后的第一件事，就是赦免了建文旧臣的家属，说“既往不咎，宜给还家产”（过去的过错不再追究，应当归还家产），还停止了大规模用兵和郑和下西洋，减免赋税，史称“洪熙新政”。
可惜这位监国多年的君主，在位仅十个月就病逝了。据《明史》记载，他临终前召杨士奇、杨荣等大臣，说“朕监国十年，唯憾未能多为百姓做实事”，并叮嘱太子朱瞻基“务守仁政，勿学骄奢”。他的猝然离世，让刚稳定下来的朝政又起波澜。
南京的百姓听说朱高炽去世，自发在聚宝门设祭，这种发自民间的悼念，或许是对他最好的评价。而他留下的仁政传统，被儿子朱瞻基继承，开创了“仁宣之治”，让明朝迎来了一段相对安定的时光。正如《明史·仁宗本纪》所赞：“在位一载，用人行政，善不胜书。使天假之年，涵濡（hánrú，）休养，德化之盛，岂不与文景比隆哉！”（在位一年，任用人才处理政务，好的事迹写也写不完。如果上天给与他更长的寿命，让百姓得到滋润养育和休养生息，道德教化的兴盛，难道不能和汉文帝、汉景帝时期相比吗！）