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会盟的高潮是“编旗”。康熙沿用漠南蒙古的盟旗制度，把喀尔喀三部编为三十七旗，每旗设札萨克（旗长），由朝廷册封。他还特意把土谢图汗的侄子封为郡王，把札萨克图汗的弟弟封为贝勒，说：“有功者赏，有罪者罚。”哲布尊丹巴请求康熙给多伦诺尔赐名，康熙想了想，说：“就叫‘汇宗寺’吧，取‘百川归海，万宗朝宗’之意。”他当场下令拨款建寺，让蒙古各部的喇嘛在这里诵经，“让佛祖见证我们的盟约”。
宴会上，康熙亲自给哲布尊丹巴倒酒，又让随行的皇子给蒙古王公们敬茶。土谢图汗喝到兴头上，跳起了蒙古舞，札萨克图汗也跟着哼起了牧歌，之前的仇怨仿佛都融进了酒里。《清实录》记载，当晚“篝火达旦，歌声震野”，有个老牧民牵着马走到康熙的大帐外，把一碗马奶酒放在帐前，说：“皇上就是草原的太阳，我们跟着太阳走，就不会迷路。”
会盟结束后，喀尔喀蒙古王公们带着朝廷赏赐的绸缎、茶叶返回漠北，数十万牧民也跟着迁了回去。康熙让人在漠北设立驿站，每隔百里建一座台站，派绿营兵驻守，既保障商旅往来，也防备噶尔丹偷袭。土谢图汗回到自己的领地后，第一件事就是把康熙赐的“和睦”金牌挂在帐篷里，对儿子说：“这金牌比我的汗位还重要。”
多伦会盟的影响，远比一场战争更深远。它让漠北蒙古正式归附清朝，结束了蒙古各部长期混战的局面，也为后来平定噶尔丹奠定了基础。《啸亭杂录》里说，此后“喀尔喀诸部岁贡驼马，遇有战事，自备粮草从征”，康熙亲征噶尔丹时，土谢图汗的骑兵冲锋在前，非常勇猛。
汇宗寺建成后，成了漠北蒙古的宗教中心。每年夏天，各旗的喇嘛都会来这里诵经，寺里的铜钟要敲一百零八下，据说“钟声能传到外蒙古的草原上”。
康熙晚年，曾派画师去多伦诺尔写生，画了一幅《多伦会盟图》。画上，康熙的龙旗在草原上飘扬，蒙古王公们围着他跪拜，远处的汇宗寺金顶闪闪发光。他在画上题了一行字：“天下一家，不分内外。”或许在这位帝王心里，真正的疆土，从来不是地图上的线条，而是百姓心里的认同——就像漠北的牧民会说“我们是大清的人”，就像汇宗寺的钟声会告诉每一个人：这里是中国的草原。