还涉及明初的社会结构、朱元璋的治国理念以及大明士绅阶层特殊地位的多重影响。
首先，郭桓案之中，户部侍郎郭桓是首恶，但郭桓这个首恶一直待在金陵，他本人没法前往各地，故郭桓之下有层层官员，到了地方，便是地方官吏与大量的士绅阶层。
朱元璋认为大明要“与百姓共天下”，严惩贪官污吏，讲究一个“重典治吏”，然朱元璋手下的人却不这么想，最典型的当数长寿的韩国公李善长。
李善长是坚定的“国朝与士大夫共天下”的支持者，这是他与朱元璋在政见上的根本分歧。
李善长清楚，士绅是明初地方社会的实际控制者，举人、进士、退职官员，还有当地的地主豪强，掌控地方经济资源，并参与到地方的行政事务，如赋税征收、司法调解之中。
朱元璋的“重典治吏”，只会起到相反的效果，扰乱大明的根基。
李善长的认识有对有错，对的是士绅阶层的确拥有巨大的能量，大到窃取国家的赋税，影响朝廷大员，他们便是郭桓在各地侵吞赋税的爪牙，更是侵吞赋税的最直接得力者。
而错在于，就算大明与他们共天下，他们的贪欲也不会停止，反而会在纵容之下愈演愈烈，使得百姓民不聊生，最终走到元末的老路上来。
洪武十八年，六月。
秦王、晋王、燕王，分别前往浙江、江西、河南三省，彻查郭桓案。
经查，三省之中布政司、提刑按察使司，以及逃税、侵占土地，私分侵吞赋税的士绅，数量更多。
三王查得心惊胆战，遂将三省之情况送往金陵，请朱元璋过目、定夺。
金陵，吏部尚书李信府邸，六部尚书已经很久未曾私下小聚，正值敏感时期，今日若非李信送信，其他五人可不敢来。
户部尚书郭允道抚须，道：“不知李兄匆忙请我等过来，是有什么大事？”
李信微微一笑，打趣道：“诸公，近日过得可好啊？特别是来学兄！”
刑部尚书开济满脸疲惫，道：“李兄就不要说笑了，刑部的案子快堆积成山了，三位殿下抓的人，已经快塞满刑部大牢。”
李信微微颔首，道：“来学兄你这叫能者多劳，其实我今日寻几位来，也为了此事。”
礼部尚书刘仲质眼珠一转，道：“李兄此言，莫非想要劝说陛下，适可而止？”
李信露出赞赏的神情，幽幽说道：“三位殿下的文书，已经送到了金陵，听说陛下发了好大脾气，若陛下继续让三位殿下清查下去，那各省官员，以及当地的士绅大族，还能保住多少？诸位的同乡、亲族、好友、门生故吏恐怕都要受牵连。”
兵部尚书赵仁眉头紧蹙，道：“李兄所言有理，我们也着急，可谁能劝得住陛下？若是贸然劝阻，惹恼了陛下，我等也要受罚，我兵部的官员被抓了五成，政务都差点维持不下去。”
工部尚书赵俊亦满脸忧愁，道：“是呀！我等往日与郭桓没有什么交集，才能独善其身，万一因进言惹得陛下不快，岂不是惹火烧身？李兄，没有周全的办法，这浑水我等就不要趟了。”
赵俊、赵仁等人不是不急，三王清查郭桓案，势必会动摇地方