争后，出于政府统治稳定的考虑，国民党多数政要对西医界利用中央卫生会议废止中医案这一举动公开表达了不满。
至此，顺理成章，废止中医案以失败告终。
为庆祝这次胜利，从1929年起，3月17日被定为“中国国医节”。
国家成立了国医馆，WH市设立了分馆。
第二次，余云岫的计划，也就这样再次胎死腹中。
此事过后，余云岫又再次偃旗息鼓，他开始致力于中西医结合教育的改革，编写了一系列新型教材，他主张在保留中医精华的同时，吸收西医的科学方法。
这期间他培养了一批被他灌输思想的学生。
接着就是第三次，也是最有名的一次。
1950年8月，第一届全国卫生大会在首都中山堂隆重召开。
会议第三天上午，轮到余云岫发言，当时72岁的他站在主席台上，再次当着全国卫生工作者的面，提出了废除中医的议案。
一时间再次震惊全场。
他阐述了三点理由：第一，中医理论缺乏科学依据，阴阳五行学说属于封建迷信；第二，中医教育缺乏规范，师徒传承模式落后；第三，中医诊断方法主观性强，难以形成统一标准。
此言论一出，当即在会场引发轩然大波，一些西医当场表示认同。
而中医则是群情激愤，想起了这位前两次的“光荣历史”，实在是没想到这么多年过去，他又蹦出来老调重弹了。
不过当时担任卫生部副部长的贺诚和王斌，对余云岫的提案表示了支持。
贺诚在讨论中指出，苏联医疗体系完全采用西医，取得了显著成效。
接着王斌则提议参照苏联模式，逐步淘汰旧医。
随后卫生部接受余云岫的思想，规定中医必须通过西医考试才能执业。
事已至此，余云岫几乎成功。
不过随后，邓铁涛带头发文做出了反击。
其余随之纷纷响应，一时间声势再起。
消息很快传到教员耳中