根据《三国志·倭人传》中“正始八年（公元247年），太守王颀到官。
倭女王卑弥呼与狗奴国男王卑弥弓呼素不和，遣倭载斯、乌越等诣郡，说相攻击状。
遣塞曹掾史张政等因赍诏书、黄幢，拜假难升米为檄告喻之”的记载，可以推断她至少活到公元247年。
而她的去世，同样充满了神秘色彩：“卑弥呼死，大作冢，径百馀步，殉葬者奴婢百馀人。更立男王，国中不服，更相诛杀，当时杀千馀人。复立卑弥呼宗女壹与，年十三为王，国中遂定。”
这段记载揭示了三个关键信息：其一，卑弥呼的葬礼规格极高，“径百馀步”的大冢（按汉代度量衡，一步约1.4米，百馀步约140米，规模远超同期普通部落首领墓葬）与“百馀人殉葬”，印证了她在邪马台国乃至部落联盟中的至高地位，也反映出当时社会已存在严重的阶级压迫；其二，卑弥呼去世后，部落联盟试图恢复“男性为王”的传统，却引发了大规模内乱，“更相诛杀，当时杀千馀人”，这从反面证明，卑弥呼的“鬼道”权威与“亲魏倭王”的身份，是维系联盟稳定的核心支柱，一旦失去，部落间的矛盾便迅速爆发；其三，最终通过拥立卑弥呼的“宗女壹与”（年仅十三岁，可能因年幼便于控制，且延续了“女性掌权”的传统），才重新稳定局势，这说明卑弥呼建立的“女性为王+宗教权威+中原册封”的统治模式，已成为邪马台国维持秩序的“既定范式”。
卑弥呼去世后，邪马台国与曹魏的外交关系由壹与延续。
《倭人传》记载：“壹与遣倭大夫率善中郎将掖邪狗等二十人送政等还，因诣台，献上男女生口三十人，贡白珠五千，青大句珠二枚，异文杂锦二十匹。”
此次朝贡的规模（二十人使团、三十名奴隶、大量珍宝）远超以往，可能是壹与为了巩固自身地位，向曹魏表达“延续忠诚”的姿态。
然而，随着曹魏政权的衰落（公元265年西晋取代曹魏）与西晋内部动荡，中原王朝对东北亚的控制力逐渐减弱，邪马台国与中原的官方联系也随之淡化。
关于邪马台国的最终结局，史料记载戛然而止。
日本本土文献《古事记》《日本书纪》（成书于公元8世纪，距卑弥呼时代已过去500余年）中，记载了“神功皇后”的传说——一位曾跨海征服朝鲜半岛的女性统治者，其形象与“事鬼道、通中原”的卑弥呼高度相似，有学者认为“神功皇后”便是卑弥呼在日本神话中的“化身”。
而考古发现显示，公元3世纪末至4世纪初，日本列岛的权力中心逐渐从北九州转移至近畿地区（今奈良、大阪一带），形成了“大和政权”（日本皇室的前身）。
有学者推测，邪马台国可能在与狗奴国的长期战争中衰落，或被新兴的大和政权吞并，其文化与政治遗产则被大和政权继承，成为日本早期国家形成的重要基础。
由于史料的稀缺，卑弥呼在很长一段时间内，只是中国正史中一个模糊的“异域女王”形象。
直到近代，随着日本明治维新后“国史编纂”的兴起，以及中日考古学的发展，卑弥呼才重新成为学术界关注的焦点。
日本学者对卑弥呼的研究，往往与“日本国家起源”的议题紧密结合——承认卑弥呼与曹魏的外交关